【法学分享第6期】常规组织病理学弱监督无标注癌检测与基因型预
发布时间:2025-10-29
多变量利用算出机更高了可解释性
早先在数字病因学方面的最深处自学研究工作发放了单变量预报波意布,使框架预报更易理解。然而,本文外皮级审计框架通过设计输出了多路预报,这须要多元的利用算出机。为了实现这一远距离,我们开发了一种三元利用算出机分析方法,该分析方法允许我们在单个波意布中所推断出恶性肿瘤测定和预报等位基因的变动(布3A)。各类病变的权威性预报布如布3B标明。这些波意布为单个恶性肿瘤的解剖统计分析发放了帮助,因为它们实际上推断出了恶性肿瘤的关联性。在与专家学者两人查看多路利用算出机地布时,我们发掘出微卫星反应性/错配修复等位基因经验丰富恶性肿瘤和微卫星不反应性/错配修复等位基因缺失恶性肿瘤一个组织(布4A,B)可以由人类观测者定位。此外,三元利用算出机地布强调了恶性肿瘤的关联性。在真正的微卫星反应性/错配修复等位基因经验丰富恶性肿瘤中所,尽管恶性肿瘤一个组织整体推断出为“紫色”(微卫星反应性/错配修复等位基因经验丰富),但恶性肿瘤常为界线时常被(错误地)归属于为微卫星不反应性/错配修复等位基因缺失 (布3B, 4A)。对顶层一个组织外皮的统计分析推断出,这些地区代表人了白血球丰富的恶性肿瘤常为界线,这是CRC的一个众所周知的基本特征。
布1-外皮级审计框架。(A)在此之后的研究工作用作带外皮级注明的乙型肝炎和中性恶性肿瘤,而外皮级审计框架在操练中所最主要了也就是说的一个组织外皮。(B)恶性肿瘤一个组织值得注意布像(紫色,微卫星反应性;采集DACHS (微卫星不反应性状况n = 2039)的也就是说一个组织(H&E),为基础并归也就是说化。利用外皮级审计框架发放病变级预报和多路空间预报布。(C)外皮级审计框架对YCR-BCIP的外部有效性性(微卫星不反应性状况n= 805)。
布2-外皮级审计框架比不上迄今最出色的框架。(A)相当外皮级审计框架(白色)和迄今最出色的框架(红色)的ROC直线推断出病变级精确性。外皮级审计框架在操练配置文件(DACHS,通过交叠有效性性审计)和外部有效性性配置文件(YCR-BCIP)中所比不上迄今最出色的框架。放大的显然推断出了在ROC空间的高灵敏度地区的性能更高。(B)每组当年五名病变的最佳预报布块。对于微卫星不反应性、微卫星反应性恶性肿瘤和也就是说一个组织的定义,以及高档次(3-4级)、很低档次(1-2级)恶性肿瘤和也就是说一个组织,外皮级审计框架鉴别出了一个组织学上可信的布像块。
布3-利用算出机交换机的预报。(A)使用恶性肿瘤测定和自体的多重空间分辨预报的三元利用算出机。基于布块预报,为每个外皮创建人三个管道(微卫星不反应性/错配修复等位基因缺失、微卫星反应性/错配修复等位基因经验丰富和也就是说一个组织)。这些管道被原属到相关联每个文档的单一波意布。(B) 微卫星不反应性/错配修复等位基因缺失和微卫星反应性/错配修复等位基因经验丰富和也就是说一个组织的试样波布。特别是微卫星反应性恶性肿瘤右下角的试样推断出,在某些情况下,恶性肿瘤外皮上可见大范围的非恶性肿瘤一个组织。
布4-外皮级审计框架测定并无关非文档一个组织,提升恶性肿瘤自体。(A)给出了两个典型案同上的数字外皮原始布和相应的波意布。微卫星反应性/错配修复等位基因恶性肿瘤周围有健康一个组织。尽管该病变被正确地重新分配了微卫星反应性/错配修复等位基因经验丰富的高分,但三变量利用算出机推断出该病变的最深处自学至少不存在轻微的关联性。(-) 为预报中性的地区,(+)为预报乙型肝炎的地区, (N)为框架预报的也就是说一个组织。(B) 微卫星不反应性/错配修复等位基因缺失类病变代表人1名。在本同上中所,恶性肿瘤一个组织至少被预报为微卫星反应性/错配修复等位基因。
本文译自《病因文档学时尚杂志》(2022年1月)
创作者:J Pathol January 2022; 256: 50–60
Published online 22 October 2021 in Wiley Online Library
(wileyonlinelibrary.com) DOI: 10.1002/path.5800
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